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PeakTrace数据分析服务

信息内容
良好的兼容性
PeakTraceDNA序列分析系统适用于ABI 310/3100/3130/3700/3730/3730xl系统。
 
操作方便
直接将KB Basecaller分析的trace(扩展名为abi 或ab1的文件)导入PeakTraceDNA序列分析系统,经过短时间处理,系统将自动生成与处理前的trace同名的文件,并存入预先指定的文件夹中(注意:不要将处理结果与KB Basecaller分析的trace存入同一个文件夹)。
 
提高读长,降低错误率
PeakTraceDNA序列分析系统从ABI KB Basecaller分析的trace中提取出原始数据,通过一系列算法从头处理,能提高测序读长,减少错误,提高通量。  

常见问题

很多数据读长超过800bp之后,分辨率比较低,经过  PeakTrace 重新分析后,能将读长增加10-200bp,使读长甚至超过1000bp,提高分辨率,那么增加的读长部分,比如800-100bp的部分,从分析后的峰图上看起来很准确,实际上这些数据可信吗?

 
经过PeakTrace 重新分析的数据,可信度都是用Qscore来评价,可以在系统中进行设置,默认条件下是20,即进行basecalling的错误概率低于1%;如果要求更高,可以设置成为30,则进行basecalling的错误概率低于0.1%。
通过实验能进行验证,比如用序列拼接或者对DNA片断进行反向测序,用实验数据和系统重新处理的结果进行比较即可。
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